Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PtprmP28828 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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