Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RxraP28700 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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