Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PrkcaP20444 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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