Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Vpreb1P13372 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms