Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms