Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms