Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms