Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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