Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SgshQ9EQ08 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms