Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms