Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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