Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Usp38Q8BW70 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Usp38Q8BW70 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Usp38Q8BW70 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Usp38Q8BW70 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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Usp38Q8BW70 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Usp38Q8BW70 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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