Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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