Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm28047Q3US59 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm28047Q3US59 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm28047Q3US59 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm28047Q3US59 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm28047Q3US59 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
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