Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Ccndbp1Q3TVC7 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Ccndbp1Q3TVC7 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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