Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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