Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms