Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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