Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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