Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hoxd4P10628 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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