Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms