Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms