Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms