Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms