Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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