Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp29Q9ES63 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms