Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccdc47Q9D024 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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