Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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Hdac9Q99N13 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Hdac9Q99N13 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hdac9Q99N13 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Hdac9Q99N13 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hdac9Q99N13 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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