Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NipblQ6KCD5 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms