Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ss18Q62280 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ss18Q62280 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ss18Q62280 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ss18Q62280 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ss18Q62280 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ss18Q62280 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ss18Q62280 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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