Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Tsr1Q5SWD9 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Tsr1Q5SWD9 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Tsr1Q5SWD9 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Tsr1Q5SWD9 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Tsr1Q5SWD9 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Tsr1Q5SWD9 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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