Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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