Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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