Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms