Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TspoP50637 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TspoP50637 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TspoP50637 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TspoP50637 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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