Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
VdrP48281 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms