Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms