Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RxraP28700 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RxraP28700 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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