Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms