Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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Brpf1B2RRD7 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Brpf1B2RRD7 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Brpf1B2RRD7 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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Brpf1B2RRD7 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Brpf1B2RRD7 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Brpf1B2RRD7 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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