Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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