Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm26992S4R1A3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms