Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Hdac6Q9Z2V5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac6Q9Z2V5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Hdac6Q9Z2V5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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