Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd1Q9Z2E2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms