Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms