Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms