Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Sh3bp5Q9Z131 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Sh3bp5Q9Z131 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms