Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms