Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn9Q9Z0S7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Cldn9Q9Z0S7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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