Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AireQ9Z0E3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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